Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkchP23298 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkchP23298 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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