Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PenkP22005 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PenkP22005 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PenkP22005 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PenkP22005 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PenkP22005 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PenkP22005 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PenkP22005 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PenkP22005 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms