Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tap1P21958 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms