Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BdnfP21237 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BdnfP21237 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BdnfP21237 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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