Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klra1P20937 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms