Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VimP20152 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VimP20152 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VimP20152 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VimP20152 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms