Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PdgfaP20033 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PdgfaP20033 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PdgfaP20033 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfaP20033 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfaP20033 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfaP20033 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfaP20033 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfaP20033 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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PdgfaP20033 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfaP20033 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfaP20033 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PdgfaP20033 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PdgfaP20033 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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