Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CtsdP18242 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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