Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpraP18052 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtpraP18052 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms