Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms