Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms