Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf2P16951 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf2P16951 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf2P16951 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms