Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sptan1P16546 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sptan1P16546 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sptan1P16546 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sptan1P16546 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sptan1P16546 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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