Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhoP15409 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoP15409 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoP15409 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoP15409 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoP15409 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RhoP15409 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RhoP15409 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RhoP15409 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms