Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srp54P14576 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms