Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrgnP13609 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrgnP13609 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms