Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Vpreb1P13372 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms