Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrm1P12657 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms