Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctla2bP12400 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctla2bP12400 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms