Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms