Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp1P08042 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp1P08042 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp1P08042 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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