Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SparcP07214 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SparcP07214 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SparcP07214 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SparcP07214 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SparcP07214 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms