Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa7P02830 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxa7P02830 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms