Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamc1P02468 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamc1P02468 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamc1P02468 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamc1P02468 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms