Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Ab1P01921 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Ab1P01921 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms