Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01748 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01748 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01748 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01748 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01748 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01748 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01748 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01748 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms