Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01740 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01740 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01740 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01740 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms