Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01641 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01641 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01641 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01641 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01641 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01641 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01641 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms