Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms