Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Casp8O89110 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms