Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hcn2O88703 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms