Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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CntfrO88507 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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CntfrO88507 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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CntfrO88507 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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CntfrO88507 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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CntfrO88507 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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CntfrO88507 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CntfrO88507 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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CntfrO88507 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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