Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AvilO88398 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AvilO88398 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AvilO88398 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AvilO88398 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AvilO88398 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AvilO88398 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms