Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp4O70480 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms