Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp8O70404 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vamp8O70404 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms