Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx1O70263 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms