Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms