Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Top3aO70157 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Top3aO70157 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top3aO70157 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top3aO70157 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms