Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChkbO55229 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChkbO55229 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms