Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aff2O55112 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aff2O55112 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aff2O55112 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aff2O55112 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff2O55112 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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