Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dsg2O55111 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms