Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syngr2O55101 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms