Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc3O55013 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms