Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NlkO54949 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NlkO54949 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NlkO54949 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NlkO54949 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms