Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn5O54942 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn5O54942 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn5O54942 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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