Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rdh16O54909 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms