Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgals6O54891 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms