Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdc4O35988 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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