Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gp1baO35930 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1baO35930 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1baO35930 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1baO35930 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms