Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifnar2O35664 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnar2O35664 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnar2O35664 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms